Gimnazijos istorija siekia 1932 metus.
1935-1936 m.m. mokymo priemonėms ir knygoms skirta 564 LT (tai sudarė 1,6 procento visos sąmatos).
1935 m. - bibliotekos darbo pradžia.
Įdomus gimnazijos gyvenimo momentas – valgymo metu visuomet kas nors iš mokinių skaito kokią naudingą knygą, o valgantieji tyliai klauso. Tai daroma dėl to, kad mokiniai išmoktų aiškiai, garsiai skaityti, išlavintų savo balsą.
Gimnazijoje buvo nustatyta griežta tvarka, kiekvieną mokinio žingsnį kontroliuodavo vienuoliai, kontroliuodavo, kokias knygas mokiniai skaito.
1940 – 1944 m.m. darbo sąlygos sunkios, nebuvo vadovėlių.
1944 - 1945 m.m. sukomplektuotos 8 gimnazijos klasės. Labai sunkiai sprendžiamas vadovėlių klausimas. Mokytojai kreipėsi, kad mokiniai perduotų vadovėlius specialiam gimnazijos fondui, iš kurio pagal galimybę skolindavo mokiniams, kurie jų visiškai neturėjo. Vadovėlius turėjo tik kas trečias mokinys.
Tarybiniais metais bibliotekos fondas komplektuojamas intensyviai, centralizuotai. Fondas labai išaugo, biblioteka virto „knygų sandėliu“. Vėliau nurašyta daug pasenusios, skaitytojų poreikių nebeatitinkančios literatūros.
Viešosios įstaigos Pranciškonų gimnazijos bibliotekos fondą sudaro 12 000 vnt. knygų, 41 vnt. audio įrašų, 143 vnt. magnetinių ir elektroninių laikmenų (CD), 80 vnt. žemėlapių, 23 pavadinimų periodiniai leidiniai. Vadovėlių fondą sudaro 20 302 vnt. vadovėlių.
Kaupiama informacinė, mokslo populiarioji, programinė ir metodinė literatūra.
